地下2階に東山線ホームがあり、地下1階の改札口は東改札口、西改札口の2ヶ所です。駅出入り口は出入り口が5ヶ所、エレベーター出入り口が1ヶ所です。ホームは錦通りの下で新千種橋西交差点の東側に東西にのびています。駅の東側に駅前広場(市バスターミナル)とJR千種駅があります。JR千種駅は地下鉄千種駅の地下1階の東側に改札口があり直結しています。駅の北側に住友生命ビルがあり、地下で直結しています。